2013年4月9日 潘基文秘书长4月9日在梵蒂冈会见了不久前刚刚当选的天主教新教皇方济各（Pople Francis，又译方济各）。双方讨论了社会公正、千年发展目标和在不同信仰间架设桥梁等诸多共同关心的议题。
潘基文在会见结束后举行的记者会上表示，教皇方济各是一位爱好和平、目标坚定、关心贫困人口的人。
潘基文指出，新教皇上任伊始就开展了外联努力，与犹太教和穆斯林团体甚至无神论者进行了接触，他对此表示赞赏。这样的努力将促进不同宗教、族裔、文化和文明之间的理解与尊重，带来宽容、包容与和平。
按照传统，潘基文邀请教皇在方便的时候访问纽约联合国总部。
上任教皇本笃十六世因健康原因退位之后，梵蒂冈经过四轮选举，终于推选出来自阿根廷首都布宜诺斯艾利斯的红衣主教伯格里奧（Jorge Mario Bergoglio）为第226任教皇，称号为方济各。这是罗马天主教历史上首次由来自美洲的红衣大主教担任教皇。
